Однажды ночью мир кардинально изменился, положив начало Четвёртой Войне за Грааль. В её завершающих этапах произошёл страшный пожар, унесший жизни многих людей. Победитель войны уничтожил саму реликвию. Спустя десять лет в городе Фуюка разворачивается новое сражение. Семья Эмии потеряла своих родителей в той трагической войне, и маленький Эмия оказался втянут в новое противостояние, не осознавая всей его серьёзности.
В школе Эмии в самый неподходящий момент появляется Сейбера, которую можно назвать верной слугой Эмии. У неё благородный и героический дух. Во время битвы Эмия также стремится помочь своей однокласснице Тосаке. Арчер, с загадочным прошлым и мастерством обращения с луком, не помнит своих прежних дел, но его навыки не оставляют сомнений в его полезности. Однако, использование парных клинков оказывается для него непростой задачей.
Чтобы одержать победу, персонажи объединяют свои усилия. Невинные люди нуждаются в их защите, и каждый из них стремится к Священному Граалю, чтобы исполнить своё заветное желание. Сражаясь друг с другом, они не знают, кто в конечном итоге сможет завоевать эту древнюю реликвию. Таким образом, их совместная борьба становится символом надежды и стремления к высшей цели, где каждый из них готов пожертвовать собой ради достижения общего блага.