Космический линкор Ямато

В 2199 году, планета Земля оказывается под угрозой вторжения инопланетной империи Гамилус, возглавляемой безжалостным Лордом Деслером. Эти захватчики, чья родная среда обитания — радиация, обрушивают на нашу планету радиоактивные астероиды, превращая её поверхность в мертвую зону. Человечество вынуждено укрыться под землей, но даже там радиация начинает оставлять свой губительный след.

В это время на Марсе происходит крушение корабля, на котором оказываются Сусуму Кодай и Дайсукэ Сима. Они обнаруживают на борту погибшую девушку с посланием от правительницы планеты Искандер. В послании Старся Искандар предлагает землянам помощь в борьбе против Гамилус, предлагая отправиться на её планету, где находится устройство, способное очистить Землю от радиоактивного заражения. Вместе с посланием была приложена инструкция по созданию мощного космического двигателя.

Сусуму и Дайсукэ находят затонувший корабль Ямато, который во время Второй Мировой войны был символом японского флота. Модифицировав его, они под командованием капитана Дзюдзо Окиты отправляются в опасное космическое путешествие к планете Искандер. У экипажа Ямато есть всего год, чтобы достичь своей цели и спасти человечество от неминуемого уничтожения.