В 2071 году человечество расширило свои границы до самых дальних уголков Солнечной Системы, от Венеры до Юпитера. Однако, трагическая техногенная катастрофа, уничтожившая Луну, привела к непредвиденным последствиям. Непрерывные метеоритные дожди сделали невозможным существование на поверхности Земли, а в первые недели после катастрофы погибло почти половина населения планеты. Выжившие массово эмигрировали в колонии на других планетах.
С течением времени преступные синдикаты укрепились по всей Солнечной Системе, и правительство решило возродить древнюю профессию охотников за головами. Теперь эти охотники, перемещаясь по всей системе, преследуют самых опасных преступников. Среди них — Спайк Шпигель и Джет Блэк, которые неожиданно оказались на борту космического корабля «Bebop 268710». Вместе с ними на корабле оказываются Фэй Валентайн, очаровательная картежница с огромным долгом, и Радикал Эдвард, юный гений компьютерных технологий, а также генетически модифицированная собака по имени Эйн.
На корабле «Bebop» четверо уникальных персонажей и одна собака начинают свои приключения, переплетаясь в сложных отношениях и опасных миссиях. Каждый из них преследует свои цели, будь то месть, поиск или просто выживание. Вместе они сталкиваются с преступным миром Солнечной Системы, где каждый день — это борьба за выживание и поиск ответов на вопросы о прошлом и будущем.