Действие аниме происходит в рамках проекта "Алисизация", где главный герой, Кирито, участвует в качестве подработки по просьбе своей знакомой. Однажды в реальном мире его находит бывший член гильдии игроков-убийц "Весёлый гроб". В ходе схватки Кирито получает серьезную травму и теряет сознание. Из-за тяжести повреждений, единственный шанс на спасение — использование передовых технологий создателей проекта.
Применяя новую систему погружения с трансформацией души, создатели переносят сознание Кирито в виртуальный мир Underworld. Там он оказывается в лесу возле деревни и знакомится с юношей по имени Юдзио. Со временем Кирито начинает вспоминать, что уже был знаком с Юдзио и что в детстве они с ним, а также с девочкой по имени Алиса, были друзьями. Эти воспоминания вносят путаницу и волнение в его новый виртуальный мир.
В Underworld Кирито сталкивается с множеством испытаний и конфликтов, которые напоминают ему о его прошлом и текущих обстоятельствах. Противостояние между лидерами мальчиков и девочек в школе добавляет напряжения, а идеальные девичьи умы и бурная энергия парней создают непредсказуемые ситуации. В этом виртуальном мире Кирито должен не только выжить, но и разобраться в своих чувствах и воспоминаниях, чтобы найти выход из сложного положения.