Действие аниме разворачивается в 1924 году в вымышленном европейском княжестве Совилль, скрытом от внешнего мира заснеженными Альпами. Главный герой, Кадзуя Кудзё, японский студент по обмену и младший сын в семье военных, поступает в престижную Академию Святой Маргариты. В этой школе распространены различные городские легенды и страшилки, многие из которых Кадзуя игнорирует, за исключением истории о «Королеве Бэрри» — мистическом призрачном корабле, который сильно его заинтриговал.
В Академии Кадзуя знакомится с Викторикой де Блуа, миниатюрной и чрезвычайно умной девушкой, которая с помощью своего острый ума и безупречной логики разгадывает тайны, неподвластные даже самым известным сыщикам города. Викторика, увлеченная реальными расследованиями, становится близким другом Кадзуи, и вместе они начинают исследовать загадочные события, связанные с академией и окружающим миром.
Их дружба и совместные приключения приводят их на борт корабля, который идеально соответствует описанию легендарной «Королевы Бэрри». Этот корабль может стать ключом к разгадке мрачной тайны, которая угрожает не только академии, но и всему княжеству. Вместе Кадзуя и Викторика будут сталкиваться с опасностями, раскрывать секреты и укреплять свои связи, проводя время в поисках правды и защиты тех, кого они любят.