В ближайшем будущем, в результате научных исследований, было предсказано падение огромного астероида на Землю, что грозит глобальной катастрофой. В ответ на этот угрожающий сценарий, правительства разных стран инициировали проект «7SEEDS», целью которого было сохранить человечество. В рамках этого проекта, молодые и физически крепкие люди были выбраны для криогенного сна, чтобы пережить апокалипсис и восстановить популяцию после него. Японские участники проекта были разделены на несколько групп, каждая из которых должна была пробудиться в безопасное время, определенное компьютерной системой.
Главной героиней истории становится шестнадцатилетняя Нацу Ивашимизу, которая приходит в себя на заброшенном корабле, окруженная группой молодых людей, таких же заблудших и растерянных, как и она сама. Все они не помнят, как попали на корабль, и что их ждет в этом новом, незнакомом мире. Группа начинает свое путешествие, наполненное опасностями и неожиданностями, пытаясь разобраться в причинах своего состояния и найти способ выжить в изменившихся условиях.
В процессе своего странствия, участники проекта «7SEEDS» сталкиваются с различными трудностями, включая выживание в дикой природе, противостояние мутировавшим животным и растениям, а также взаимодействие с другими выжившими. Каждый из них должен научиться работать в команде, преодолевая личные страхи и разногласия, чтобы выжить и найти способ восстановить человеческую цивилизацию. История наполнена драматическими моментами, глубокими раздумьями о судьбе человечества и личными переживаниями героев, что делает её захватывающим и эмоционально насыщенным произведением.