Мамору Кагэмори, на первый взгляд, кажется обычным неуклюжим парнем с небрежно расчесанными волосами и толстыми очками. Однако, за этим обликом скрывается нечто гораздо более значительное — он наследник древней ниндзя-династии, которая на протяжении четырех столетий тайно охраняла семью Конняку. С самого детства Мамору был обречен на роль защитника Юны Конняку, дочери этой семьи, с которой он дружил с садовых лет.
Юна Конняку, обычная старшеклассница с ярким и жизнерадостным нравом, не подозревает о тайной роли Мамору в ее жизни. Однако, когда опасность грозит ей в самый неожиданный момент, Мамору не колеблясь надевает свой ниндзя-костюм и превращается в невероятно умелого и ловкого воина. Его навыки ниндзя, передаваемые из поколения в поколение, позволяют ему защищать Юну от самых разнообразных угроз, оставаясь при этом невидимым для нее и окружающих.
Секретный мир Мамору и его обязательства перед семьей Конняку становятся все более сложными и запутанными по мере того, как он пытается совмещать свою обычную школьную жизнь с тайными миссиями ниндзя. В то время как Юна начинает замечать странности в поведении своего старого друга, Мамору изо всех сил старается скрыть свою истинную сущность. Эта двойная жизнь ставит его перед множеством испытаний, но также и открывает перед ним новые возможности для роста и самопознания.